Caracterización de microsatélites en los géneros ensis y mytilus y estudio de la degeneración de secuencias repetitivas inferido del genoma humano

Abstract

Los microsatélites constituyen regiones del genoma de especial interés tanto por sus peculiares características mutacionales como por su utilización como marcadores genéticos. En esta tesis se analizaron distintas muestras mejillones del género Mytilus y de navajas del género Ensis mediante marcadores microsatélite y marcadores ISSR (Inter-Simple-Sequence Repeat) que se basan en la amplificación de fragmentos de ADN situados entre dos microsatélites lo suficientemente cercanos como para ser amplificados por PCR. Complementariamente se analizó la distribución de las interrupciones presentes en los microsatélites caracterizados en el presente estudio y en los contenidos en las bases de datos del genoma humano. Mediante el polimorfismo de los marcadores ISSR en el género Mytilus se identificaron muestras procedentes de las dos principales zonas de hibridación de dicho género en Europa, el mar Báltico y las Islas Británicas-Noroeste de Francia. El análisis molecular de la varianza apoya la existencia de un intenso flujo génico entre las localidades de muestreo de la costa atlántica europea. Los resultados de un AMOVA y un análisis bayesiano indican la existencia de una estructura poblacional poco pronunciada entre las localidades analizadas y una alta variabilidad genética dentro de cada localidad, abarcando hasta un 85 % de la diversidad haplotípica. Los microsatélites analizados en este estudio se aislaron a partir de la secuenciación de los propios ISSR y de la elaboración de una genoteca enriquecida. El análisis multivariante, el árbol NJ y los estimadores de FST calculados en base a la variabilidad genética de los marcadores microsatélite en Ensis siliqua, indican la existencia de una ligera diferenciación genética entre las localidades gallegas de Finisterre y Cangas, con respecto a las portuguesas, Olhao y Setúbal, así como una clara diferenciación entre estas localidades y la irlandesa de Strangford Lough. Esta diferenciaci