Aplicación de los espaciadores ribosomales nucleares transcritos en la filogenia y filogeografía de especies mediterráneas de distribución restringida

Abstract

A pesar que la región ITS es una de las más utilizadas en estudios filogenéticos, su uso se ha restringido mayoriatariamente a nivel infragenérico y su posible utilidad para establecer las relaciones evolutivas entre especies o complejos de especies estrechamente emparentaods y/o de distribución restringida ha sido mucho menos frecuente. Por otra parte, la mayor parte de los estudios publicados asumen que la variación intraespecífica es inexistente o despreciable para la mayoria de los taxones. Además algunos han detectado copias divergentes de dichos espaciadores dentro de un mismo genoma en grupos taxonómicos filogeneticamente alejados. Esta variació se ha interpretado como la presencia de multiple loci (parálogos), algunos acumulando mutaciones a lo largo del tiempo dando lugar en ultima instancia a pseudogenes. Para detectar y caracterizar las copias divergentes de los parálogos en la región ITS es necesaria realizar la clonación de los productos amplificados mediante la reacción en cadena de la polimersa. Por lo tanto lo niveles de divergencia intraespecífica e intragenómica podrían ser infravalorados si el genotipo delITS es analizado por secuenciación de una muestra no representativa o si no se tiene en cuenta las posibles ambiguedades. Los objetivos fueron: 1)Analizar los niveles de variación para este marcador en diversas especies mediterráneas de distribución restringida, tanto a nivel de población como a nivel individual 2) Evaluar su utilidad para esclarecer las relaciones filogenéticas en especies o complejos de especies altamente emparentados. Para ello se seleccionaron tres especies o complejos de distribución restringida: Rosmarinus officinalis L. y taxones relacionados Buxus balearica Lam. El complejo Cephalaria squamiflora