Hybridization as an evolutionary driver for speciationA case in the Southern European Erysimum species

Resumen

El objetivo principal de esta tesis doctoral ha sido desenmarañar el papel de la hibridación y de la poliploidización en la evolución de las plantas, utilizando como caso de estudio a un conjunto de pares de especies de Erysimum del sur de Europa: E. nevadense y E. baeticum; E. mediohispanicum y E. bastetanum; E fitzii y E. popovii. Estas especies habitan las montañas a veces en simpatría. Nuestra hipótesis central era que estos procesos podrían haber tenido una influencia significativa en la evolución de estas especies, dejando una firma en sus genomas. Este estudio se abordó teniendo en cuenta que estos y otros procesos evolutivos tienen lugar a nivel de población, y que por ello la variabilidad intraespecífica debía incorporarse explícitamente en todos los análisis. Planteamos además la hipótesis de que la señal de hibridación podría ser más patente en las especies con corolas púrpuras, ya que este fenotipo podría haberse visto favorecido por la introgresión adaptativa. En primer lugar, hemos tratado de dilucidar en qué medida las secuencias de ITS fueron homogeneizadas por la evolución concertada (Capítulo I). Encontramos que estas secuencias nucleares no fueron completamente homogeneizadas, lo que sugiere una firma de hibridación reciente para estas especies de Erysimum. En segundo lugar, hemos reunido los genomas del cloroplasto de estas especies a partir de los datos del ARN-Seq, demostrando la fiabilidad de esta estrategia para proporcionar genomas completos de ADNcp (Capítulo II). Tras ello, hemos proporcionado nuevos recursos genómicos para el estudio de las especies de Erysimum, como transcriptomas ensamblados y anotados de novo. Siguiendo esta metodología, hemos ensamblado y anotado los genomas del cloroplasto, reconstruyendo una filogenia calibrada en el tiempo (Capítulo III). Finalmente, hemos estudiado el escenario general de hibridación en presencia de ILS para estas especies, combinando datos nucleares y del cloroplasto (Capítulo IV). Nuestro trabajo indica que la introgresión ha sido ubicua en las especies estudiadas, incluso las especies diploides mostraban una firma de introgresión en sus genomas. Estos resultados inciden en la gran importancia de la hibridación y la poliploidización en la evolución del mundo vegetal en general y del género Erysimum en particular.