Estudio de los factores implicados en la regulación de la expresión del elemento LINE-L1Tc de Trypanosoma cruzi y de los mecanismos de control de su transposición
- Manuel Carlos López López Director/a
- M. Carmen Thomas Carazo Codirector/a
Universidad de defensa: Universidad de Granada
Fecha de defensa: 28 de mayo de 2007
- Margarita Salas Falgueras Presidente/a
- Antonio Sánchez Pozo Secretario
- Carlos Alonso Bedate Vocal
- Antonio Fernández Martínez Vocal
- Carles Suñé Negre Vocal
Tipo: Tesis
Resumen
En Trypanosoma cruzi, las secuencias repetidas se han relacionado con la plasticidad de su genoma, sugieriéndose además que pueden estar implicadas en fenómenos de reordenamiento y control de la expresión de génica.La comparación del contenido genómico de T. cruzi, Trypanosoma brucei y Leishmania major ha revelado que los pocos lugares donde existen reordenamientos genómicos entre estas especies están marcados por la presencia de retrotransposones, lo que sugiere que estos elementos pueden haber jugado un importante papel en la evolución y formación de la actual estructura genómica de los tripanosomátidos Objetivos: 1- Caracterización molecular de un elemento, potencialmente de tipo retrotransposón no-LTR no autónomo, al que denominamos NARTc, identificado en el genoma de T. cruzi asociado a secuencias de DNA repetido. 2- Identificación y estudio de potenciales secuencias promotoras y reguladoras contenidas en el elemento L1Tc: 2.1- Estudio del papel funcional como promotor interno de los primeros 77 pb que comparten los retrotransposones L1Tc y NARTc. 2.2- Determinación de la funcionalidad in vitro e in vivo de una secuencia polipeptídica, similar a las secuencias virales autoprocesables 2A, codificada en el extremo 5' del elemento L1Tc y en fase con las proteínas enzimáticas que codifica este elemento. 3- Estudio de la capacidad de unión a ácidos nucleicos del dominio codificado por el extremo 3' del elemento L1Tc, denominado C2-L1Tc y de su actividad funcional. 4- Estudio de los motivos contenidos en la proteína C2-L1Tc que intervienen en la unión a ácidos nucleicos de cadena sencilla y de cadena doble, así como de los motivos involucrados en su actividad chaperona de ácidos nucleicos. Conclusiones: 1-El genoma de Trypanosoma cruzi contiene, repetido y disperso, un retrotransposón no-LTR de tipo SINE-like al que hemos denominado NARTc. Las características que tiene en común con el elemento LINE L1Tc sugieren que su movi