El intrón del grupo II de sinorhizobium meliloti, rmint1estudios ecológicos y caracterización molecular de las actividades bioquímicas implicadas en su movilidad

Resumen

En nuestro laboratorio se ha descrito el primer intrón del grupo II del orden Rhizobiales, inicialmente encontrado en la cepa GR4 de S.meliloti. Este intrón presenta unas características a nivel de estructura primaria y secundaria que le hacen diferente de los intrones móviles del grupo II hasta ahora descritos. En este trabajo de Tesis Doctoral hemos llevado a cabo estudios sobre la presencia y distribución del intrón RmInt1 en la cepa tipo de S.meliloti 1021, así como diversos estudios ecológicos para conocer el comportamiento y dinámica de RmInt1 en poblaciones naturales de S.meliloti. Hemos analizado la presencia de RmInt1 en otras especies bacterianas y hemos ensayado la capacidad de movimiento fuera de su hospedador natural S.meliloti. Para comprender el mecanismo de dispersión de este elemento dentro de la misma especie e incluso entre especies distintas hemos llevado a cabo estudios para la caracterización molecular del mecanismo de movimiento del intrón. Por último, hemos analizado in vitro las actividades bioquímicas del intrón RmInt1. Los resultados más significativos se resumen a continuación: La cepa tipo de S.meliloti 1021 presenta en su genoma seis copias de intrones del grupo II: 1 copia completa de SMb21477 y 1 copia truncada (SMb21167) (clase IIC), 1 copia e SMa1875 (no clasificado) y 3 copias de RmInt1 (clase IIB3). El intrón RmInt1 parece carecer de movilidad autónoma en el genoma de 1021. La dispersión del intrón RmInt1 en poblaciones naturales de aislados de S.meliloti ocurre tanto asociada a la transposición del elemento compuesto ISRm2011-2::RmInt1 como de forma independiente. Esta dispersión autónoma de RmInt1 se realiza mediante los procesos de homing y transposición ectópica. La cepa 5D19 de S.adhaerens es portadora de una única copia de RmInt1 insertada en una nueva secuencia de inserción, ISRm10-3. Podría tratarse de un evento de transferencia génica horizontal desde