Ribozimas hairpin y hammerhead como base para el diseño de RNAS inhibidores

Abstract

A principio de la década de los ochenta se describió por primera vez la capacidad de ciertas moléculas de RNA para catalizar reacciones químicas. A estas moléculas de RNA se las denominó ribozimas, y desde entoces han sido sometidas a un exahustiva estudio para determinar sus características. La mayoría de las ribozimas naturales catalizan las reacciones de corte y/o ligación de otras moléculas de Rna (sustrato), de un modo altamente específico de secuencia. Estas características ha hecho que se desarrolle una tecnología de ribozimas encaminada hacia la generación de nuevas herramientas terapéuticas. La catálisis química mediada por ribozimas requiere el contar con motivos catalíticos capaces de interaccionar de un modo efectivo conla moléucla diana. El objetivo principal de esta Tesis Doctoral consistió en la generación de nuevas moléculas inhibidoras, basadas en ribozimas, con las características de interacción al sustrato optimizadas. Estas nuevas moléculas inhibidoras se denominaron RNAs antisense catalíticos. En la Naturaleza existen sistemas en los cuales la regulación de diversos procesos está mediada por la interacción eficiente entre moléculas de RNA; son los sistemas de los RNAs antisense naturales, y un exhaustivo conocimiento de los mismos permite afirmar que la velocidad de asociación entre estas moléculas de RNA, y la especificidad del sistema vienen determinada por la presencia de elementos estructurales tallo-lazo en estas moléculas. El conocimiento obtenido del estudio de estos sistemas naturales nos proporcionó la información necesaria para la generación de los RNAs antisense catalíticos. Se trata de moléculas de RNA compuestas por un motivo catalítico, robozimas hairpin ó hammerhead, y de un motivo antisense, estructura tallo-lazo complementaria a una presente en el RNA sustrato. Las moléculas generadas se ensayaron frente a sustratos artificiales de distinta longitud, co