Methodological Approach to Conformational Search. A Study CaseCyclodextrins

  1. Burusco Goñi, Kepa Koldo
Supervised by:
  1. Carlos Jaime Cardiel Director

Defence university: Universitat Autònoma de Barcelona

Fecha de defensa: 09 October 2009

Committee:
  1. Antonio José Entrena Guadix Chair
  2. Xavier Grabuleda Salart Secretary
  3. María Isabel Rozas Hernando Committee member

Type: Thesis

Teseo: 281091 DIALNET lock_openTDX editor

Abstract

No és difícil trobar exemples que mostrin la inqüestionable importància de la estereoquímica en temes com la salut o l'economia: D'una banda, la quiralitat és tristament ben coneguda a causa del desastre de la Talidomida. Per altra banda, varem trobar recentment un altre exemple no menys important dins el camp de les conformacions de macromolècules: La Malaltia de Creutzfeld-Jacob. Per això, creiem que és rellevant examinar amb més detall aquells temes relacionats amb els estudis conformacionals.A la present Tesi Doctoral es proposa un procés en dues etapes per a estudiar espais conformacionals de macromolècules mitjançant Simulated Annealing (SA) i Dinàmica Molecular (DM). Ambdues metodologies són ben conegudes dins el camp de la Modelització Molecular; no obstant això, la principal contribució aportada per aquest treball és el desenvolupament d'eines metodològiques millorades -descriptors moleculars adequats, anàlisi de saturació de conformacions i grau de solapament de trajectòries- per mesurar quantitativament l'evolució i convergència dels càlculs SA i MD.