Cdnl, un gen esencial en myxococcus xanthus

Resumen

En este trabajo se ha estudiado el gen cdnL de Myxococcus xanthus. Este gen se identificó por la similitud de la secuencia de la proteína CdnL con la del dominio N-terminal de CarD, un factor transcripcional de acción global. CdnL y NterCarD forman parte de la familia proteica pfam02559, que incluye un amplio número de proteínas bacterianas. A pesar de su similitud, CdnL no es funcional ni estructuralmente equivalente a NterCarD. El gen cdnL es esencial para M. xanthus, y el bloqueo temporal de su expresión hace que las células sean inusualmente alargadas, conteniendo, aparentemente, más de dos nucleoides. Sin embargo, la sobreexpresión de cdnL no afecta a la viabilidad celular. In vivo, la proteína CdnL fusionada a EGFP localiza exclusivamente en el nucleoide. En este trabajo también se ha caracterizado la región promotora del gen cdnL y los resultados obtenidos indican que dicho gen es dependiente del factor sigma vegetativo SigA. La proteína CdnL interacciona consigo misma y no se une a la polimerasa de RNA de M. xanthus. CdnL está constituida por dos dominios: NterCdnL, formado por los primeros 60 aminoácidos y muy sensible a la acción de proteasas, y CterCdnL, formado por los 104 últimos aminoácidos y muy resistente a la acción de proteasas. La proteína homóloga a CdnL en Thermus thermophilus (TtCdnL) muestra la misma disposición de dominios, sensible y resistente a proteasas, que CdnL. Ni el dominio CterCdnL, ni 4 miembros de pfam02559 de distintos taxones, ni la quimera NterCdnL:CterTtCdnL suplen la ausencia de CdnL en M. xanthus. CdnL interacciona in vivo con la subunidad A de una topoisomerasa de tipo II, con la proteasa Lon y con la sintetasa de acilCoA.